Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd6Q61003 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms