Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rbbp7Q60973 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rbbp7Q60973 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rbbp7Q60973 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp7Q60973 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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