Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms