Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms