Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms