Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms