Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tdrd5Q5VCS6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tdrd5Q5VCS6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tdrd5Q5VCS6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms