Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms