Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms