Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms