Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms