Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf3Q5HZG4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms