Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms