Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
R3hdm4Q4VBF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
R3hdm4Q4VBF2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms