Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shank3Q4ACU6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shank3Q4ACU6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms