Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms