Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms