Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BC051142Q3V0M8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC051142Q3V0M8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BC051142Q3V0M8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BC051142Q3V0M8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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