Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms