Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc27Q3V036 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc27Q3V036 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms