Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms