Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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