Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms