Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf48Q3US17 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Znf48Q3US17 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Znf48Q3US17 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf48Q3US17 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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