Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UPC7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UPC7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms