Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms