Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpr55Q3UJF0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms