Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms