Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zyg11bQ3UFS0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms