Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmd8Q3UFK8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms