Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms