Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms