Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ssbp4Q3U4B1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ssbp4Q3U4B1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ssbp4Q3U4B1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ssbp4Q3U4B1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms