Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec24aQ3U2P1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms