Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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