Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms