Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms