Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms