Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbxip1Q3TVI8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms