Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms