Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms