Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stt3bQ3TDQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms