Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms