Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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