Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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