Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd3Q14AI6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd3Q14AI6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd3Q14AI6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd3Q14AI6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd3Q14AI6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms