Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Traf3ip1Q149C2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms