Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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VgfQ0VGU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms