Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms