Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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